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可用的设计选项
SYBR Green试验设计
SYBR Green可能是实时PCR化学中常用的。Beacon Designer设计SYBR Green PCR引物，帮助您评估预先设计的SYBR Green PCR引物集。您可以完全控制设计参数，或者您可以使用默认值，在经过大量的研究和与的交流之后选择。您甚至可以为您的特定研究需求选择您自己的默认设计参数。
除了在感兴趣的基因上定位引物外，信标设计者还可以设计外显子或外显子内含子连接的引物。这些引物设计的外显子内含子连接有助于选择性帮助从gDNA选择性扩增cDNA。
HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析（HRMA）是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法，可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变，产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构，保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索，以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
SYBR® Green Primer Design
TaqMan® Probe Design
Multiplex Real Time PCR Assay Design
HRMA Primer Design
MethyLight TaqMan® Design
Molecular Beacon Design
NASBA® Assay Design
FRET Probe Design
Scorpions® Design
Avoiding Cross Homology- For Specific Oligo Design
Avoid Template Structures- Increase Primer Efficiency
Oligo Rating

TaqMan® Probes
Use Beacon Designer™ for optimal TaqMan® probes that help you study the differential gene expression or study SNP (single nucleotide polymorphisms) using TaqMan® SNP genotyping assays. You can also choose to design the increasingly popular Locked Nucleic Acid (LNA™) substituted TaqMan® probes, which are more stable than standard TaqMan® probes. To study DNA methylation, Beacon Designer™ helps design primers and TaqMan® probes for MethyLight assays. MethyLight is a high throughput assay used to discriminate between methylated and unmethylated DNA. Using Beacon Designer™, you can design suitable control primers and probes by designing oligos for the methylated and the unmethylated strands, and for the untreated DNA sequence. With any of these chemistries, you could evaluate a pre-designed/published primers or TaqMan® probes. The design results are reported in a ranked order, giving you a list of alternates to choose from. Depending on the oligo properties, a rating is assigned. Please read the Rating section in the online help for details.

双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质：
 TaqMan探针
使用Beacon Designer优化TaqMan探针，帮助您研究差异基因表达或使用TaqMan SNP基因型检验研究SNP（单核苷酸多态性）。您也可以选择设计越来越流行的锁定核酸（LNA）取代TaqMan探针，这些探针比标准TaqMan探针更稳定。为了研究DNA甲基化，Beacon Designer帮助设计引物和TaqMan探针进行甲基化分析。甲基光是一种高通量分析，用于区分甲基化和非甲基化DNA。使用Beacon Designer，通过设计甲基化和未甲基化链的寡核苷酸，以及未经处理的DNA序列，可以设计合适的控制引物和探针。有了这些化学物质，您可以评估预先设计的引物或TaqMan探针。设计结果按顺序排列，给您一个可供选择的替代品列表。根据oligo的属性分配等级。
 Molecular Beacons
为NASBA检验设计或评估标准的分子信标或分子信标。NASBA是一种引物依赖技术，可用于在同一温度下单个混合物中连续扩增核酸。现在您可以为单分子模板或多重反应的分子信标设计NASBA检验。
Scorpions
Beacon Designer支持Scorpions引物和探针的设计。Scorpions的分析是很重要的，它们与探针的酶切割无关。引物和探针元件在反应过程中物理耦合。
FRET探针
Beacon Designer支持设计和评估预先设计的FRET探针。与预先设计的SYBR Green引物兼容的FRET探针可以在Beacon Designer中设计。

Scorpions®
Beacon Designer™ supports the design of Scorpions® primers and probes. Scorpions® assays are important in that they are independent of the enzymatic cleavage of the probe. The primer and probe element are physically coupled during the reaction. Read more about the Scorpions® technology.
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